Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms