Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkceP16054 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkceP16054 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkceP16054 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PrkceP16054 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkceP16054 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.4 ms