Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd44P15379 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd44P15379 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd44P15379 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd44P15379 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd44P15379 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd44P15379 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd44P15379 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd44P15379 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd44P15379 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd44P15379 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd44P15379 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd44P15379 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cd44P15379 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd44P15379 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd44P15379 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd44P15379 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd44P15379 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd44P15379 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd44P15379 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd44P15379 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd44P15379 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd44P15379 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd44P15379 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd44P15379 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd44P15379 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd44P15379 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd44P15379 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd44P15379 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd44P15379 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd44P15379 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd44P15379 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd44P15379 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd44P15379 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd44P15379 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd44P15379 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd44P15379 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd44P15379 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd44P15379 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd44P15379 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd44P15379 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd44P15379 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd44P15379 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd44P15379 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd44P15379 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd44P15379 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd44P15379 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd44P15379 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd44P15379 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd44P15379 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd44P15379 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd44P15379 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd44P15379 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd44P15379 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd44P15379 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd44P15379 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd44P15379 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd44P15379 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd44P15379 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd44P15379 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd44P15379 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd44P15379 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms