Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DmdP11531 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DmdP11531 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DmdP11531 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DmdP11531 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DmdP11531 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DmdP11531 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DmdP11531 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DmdP11531 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DmdP11531 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DmdP11531 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DmdP11531 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DmdP11531 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DmdP11531 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DmdP11531 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DmdP11531 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DmdP11531 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DmdP11531 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DmdP11531 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DmdP11531 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DmdP11531 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DmdP11531 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DmdP11531 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DmdP11531 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DmdP11531 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DmdP11531 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DmdP11531 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DmdP11531 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DmdP11531 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DmdP11531 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DmdP11531 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DmdP11531 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DmdP11531 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DmdP11531 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DmdP11531 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DmdP11531 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DmdP11531 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DmdP11531 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DmdP11531 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DmdP11531 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DmdP11531 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DmdP11531 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DmdP11531 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DmdP11531 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DmdP11531 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DmdP11531 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DmdP11531 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DmdP11531 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DmdP11531 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DmdP11531 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DmdP11531 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DmdP11531 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DmdP11531 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DmdP11531 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DmdP11531 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DmdP11531 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DmdP11531 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DmdP11531 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DmdP11531 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DmdP11531 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DmdP11531 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DmdP11531 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DmdP11531 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DmdP11531 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DmdP11531 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DmdP11531 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DmdP11531 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DmdP11531 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DmdP11531 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DmdP11531 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DmdP11531 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DmdP11531 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DmdP11531 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DmdP11531 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DmdP11531 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DmdP11531 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DmdP11531 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DmdP11531 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DmdP11531 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DmdP11531 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DmdP11531 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DmdP11531 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DmdP11531 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DmdP11531 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DmdP11531 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DmdP11531 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DmdP11531 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DmdP11531 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DmdP11531 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DmdP11531 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DmdP11531 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DmdP11531 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DmdP11531 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DmdP11531 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DmdP11531 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DmdP11531 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DmdP11531 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DmdP11531 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DmdP11531 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DmdP11531 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms