Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a1P11087 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms