Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P10404 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P10404 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P10404 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
P10404 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P10404 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P10404 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P10404 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P10404 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P10404 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P10404 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P10404 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P10404 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P10404 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P10404 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P10404 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P10404 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P10404 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P10404 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P10404 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P10404 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P10404 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P10404 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P10404 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P10404 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P10404 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P10404 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P10404 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P10404 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P10404 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P10404 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P10404 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P10404 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P10404 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P10404 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P10404 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P10404 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P10404 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
P10404 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P10404 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
P10404 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P10404 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P10404 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P10404 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P10404 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P10404 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
P10404 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P10404 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P10404 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P10404 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P10404 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P10404 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P10404 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P10404 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P10404 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P10404 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P10404 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P10404 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P10404 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P10404 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P10404 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P10404 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P10404 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P10404 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P10404 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P10404 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P10404 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P10404 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P10404 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P10404 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P10404 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P10404 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P10404 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P10404 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P10404 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P10404 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P10404 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P10404 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P10404 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P10404 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P10404 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P10404 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P10404 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P10404 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P10404 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P10404 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P10404 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P10404 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P10404 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P10404 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P10404 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P10404 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P10404 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P10404 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P10404 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P10404 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P10404 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P10404 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms