Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CatspereP0DP43 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms