Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc1bP0C7A0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms