Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Igsf6P0C6B7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms