Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Surf1P09925 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Surf1P09925 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Surf1P09925 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Surf1P09925 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Surf1P09925 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Surf1P09925 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf1P09925 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf1P09925 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf1P09925 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Surf1P09925 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms