Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf3P09920 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf3P09920 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf3P09920 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf3P09920 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3P09920 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3P09920 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Csf3P09920 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csf3P09920 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms