Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxc9P09633 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxc9P09633 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Hoxc9P09633 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms