Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms