Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxc8P09025 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc8P09025 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms