Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Spta1P08032 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spta1P08032 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spta1P08032 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spta1P08032 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spta1P08032 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Spta1P08032 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spta1P08032 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spta1P08032 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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