Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TnfP06804 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TnfP06804 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TnfP06804 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TnfP06804 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TnfP06804 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TnfP06804 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TnfP06804 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TnfP06804 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TnfP06804 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TnfP06804 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TnfP06804 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TnfP06804 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TnfP06804 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TnfP06804 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TnfP06804 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TnfP06804 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TnfP06804 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TnfP06804 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TnfP06804 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TnfP06804 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TnfP06804 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TnfP06804 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TnfP06804 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TnfP06804 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TnfP06804 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TnfP06804 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TnfP06804 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TnfP06804 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TnfP06804 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TnfP06804 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TnfP06804 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TnfP06804 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TnfP06804 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TnfP06804 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TnfP06804 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TnfP06804 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TnfP06804 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TnfP06804 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TnfP06804 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TnfP06804 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TnfP06804 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TnfP06804 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TnfP06804 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TnfP06804 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TnfP06804 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TnfP06804 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TnfP06804 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TnfP06804 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TnfP06804 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TnfP06804 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TnfP06804 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TnfP06804 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TnfP06804 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TnfP06804 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TnfP06804 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TnfP06804 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TnfP06804 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TnfP06804 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TnfP06804 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TnfP06804 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TnfP06804 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TnfP06804 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms