Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb1bP06795 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb1bP06795 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb1bP06795 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb1bP06795 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb1bP06795 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb1bP06795 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Abcb1bP06795 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Abcb1bP06795 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcb1bP06795 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb1bP06795 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms