Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myl1P05977 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Myl1P05977 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myl1P05977 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myl1P05977 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myl1P05977 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myl1P05977 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myl1P05977 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myl1P05977 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Myl1P05977 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myl1P05977 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Myl1P05977 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myl1P05977 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myl1P05977 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms