Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgamP05555 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgamP05555 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgamP05555 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgamP05555 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgamP05555 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms