Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Got1P05201 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Got1P05201 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Got1P05201 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Got1P05201 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Got1P05201 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Got1P05201 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Got1P05201 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Got1P05201 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Got1P05201 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Got1P05201 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Got1P05201 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Got1P05201 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Got1P05201 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Got1P05201 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Got1P05201 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Got1P05201 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Got1P05201 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Got1P05201 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Got1P05201 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Got1P05201 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Got1P05201 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Got1P05201 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Got1P05201 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Got1P05201 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Got1P05201 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Got1P05201 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Got1P05201 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Got1P05201 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Got1P05201 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Got1P05201 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Got1P05201 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Got1P05201 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Got1P05201 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Got1P05201 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Got1P05201 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Got1P05201 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Got1P05201 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Got1P05201 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Got1P05201 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Got1P05201 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Got1P05201 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Got1P05201 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Got1P05201 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Got1P05201 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Got1P05201 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Got1P05201 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Got1P05201 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Got1P05201 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Got1P05201 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Got1P05201 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Got1P05201 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Got1P05201 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Got1P05201 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Got1P05201 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Got1P05201 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Got1P05201 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Got1P05201 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Got1P05201 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Got1P05201 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Got1P05201 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Got1P05201 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Got1P05201 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Got1P05201 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Got1P05201 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Got1P05201 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Got1P05201 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Got1P05201 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Got1P05201 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Got1P05201 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Got1P05201 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Got1P05201 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Got1P05201 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Got1P05201 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Got1P05201 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Got1P05201 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Got1P05201 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Got1P05201 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Got1P05201 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Got1P05201 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Got1P05201 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Got1P05201 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Got1P05201 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Got1P05201 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Got1P05201 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Got1P05201 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Got1P05201 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms