Protein–RNA interactions for Protein: P04219

Putative uncharacterized Ig-region protein, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04219 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04219 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04219 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04219 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04219 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04219 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04219 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04219 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04219 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04219 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04219 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04219 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04219 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04219 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04219 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04219 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04219 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P04219 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04219 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04219 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04219 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04219 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04219 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04219 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04219 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04219 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P04219 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04219 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04219 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04219 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04219 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04219 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04219 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04219 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04219 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04219 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04219 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04219 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04219 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04219 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04219 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04219 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04219 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04219 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04219 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04219 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04219 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04219 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P04219 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04219 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04219 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04219 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04219 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04219 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04219 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04219 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04219 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04219 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04219 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04219 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04219 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04219 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04219 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04219 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04219 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04219 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04219 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04219 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04219 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms