Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04214 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04214 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P04214 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P04214 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P04214 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
P04214 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P04214 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P04214 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P04214 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P04214 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P04214 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
P04214 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P04214 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P04214 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P04214 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P04214 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P04214 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P04214 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
P04214 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P04214 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
P04214 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P04214 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P04214 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P04214 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P04214 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P04214 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P04214 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P04214 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P04214 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P04214 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P04214 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P04214 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
P04214 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P04214 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P04214 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P04214 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P04214 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P04214 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P04214 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P04214 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P04214 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P04214 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P04214 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P04214 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P04214 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P04214 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P04214 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P04214 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P04214 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P04214 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P04214 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P04214 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04214 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04214 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04214 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04214 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04214 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04214 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04214 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04214 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04214 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04214 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04214 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04214 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04214 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04214 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
P04214 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P04214 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P04214 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P04214 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P04214 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P04214 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P04214 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P04214 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04214 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04214 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04214 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04214 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04214 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04214 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04214 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04214 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P04214 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P04214 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P04214 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P04214 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04214 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04214 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04214 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04214 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04214 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04214 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04214 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04214 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04214 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04214 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04214 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04214 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04214 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms