Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04212 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04212 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04212 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04212 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04212 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04212 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04212 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04212 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04212 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P04212 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04212 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04212 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04212 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04212 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04212 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04212 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04212 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04212 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04212 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04212 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P04212 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04212 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P04212 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04212 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04212 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04212 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04212 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04212 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04212 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04212 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04212 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04212 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04212 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P04212 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04212 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04212 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04212 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04212 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04212 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04212 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04212 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04212 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P04212 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04212 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04212 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04212 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04212 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P04212 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P04212 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04212 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04212 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04212 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04212 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04212 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04212 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04212 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04212 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04212 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04212 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P04212 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms