Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt10P02535 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt10P02535 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt10P02535 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt10P02535 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt10P02535 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt10P02535 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms