Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01853 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01853 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01853 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01853 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01853 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01853 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01853 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01853 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01853 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01853 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01853 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01853 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01853 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01853 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01853 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01853 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01853 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01853 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01853 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01853 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01853 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01853 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01853 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01853 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01853 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01853 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01853 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01853 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01853 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01853 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01853 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01853 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01853 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01853 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01853 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01853 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01853 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01853 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01853 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01853 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01853 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01853 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01853 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01853 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms