Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01822 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01822 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01822 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01822 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01822 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01822 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01822 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01822 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01822 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01822 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01822 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01822 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01822 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01822 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01822 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01822 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01822 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01822 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01822 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01822 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01822 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01822 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01822 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01822 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01822 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01822 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01822 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01822 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01822 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01822 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01822 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01822 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01822 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01822 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01822 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01822 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01822 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01822 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01822 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01822 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01822 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01822 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01822 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01822 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01822 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01822 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01822 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01822 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01822 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01822 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01822 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01822 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01822 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01822 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01822 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01822 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01822 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01822 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01822 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01822 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01822 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01822 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01822 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01822 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01822 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01822 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01822 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01822 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01822 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01822 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01822 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01822 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01822 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01822 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01822 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms