Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01790 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01790 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01790 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01790 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01790 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01790 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01790 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01790 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01790 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01790 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01790 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01790 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01790 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01790 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01790 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01790 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01790 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01790 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01790 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01790 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01790 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01790 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01790 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01790 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01790 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01790 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01790 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01790 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01790 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01790 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01790 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01790 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01790 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01790 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01790 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01790 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01790 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01790 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01790 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01790 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01790 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01790 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01790 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01790 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms