Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01788 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01788 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01788 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01788 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01788 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01788 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01788 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01788 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01788 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01788 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01788 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01788 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01788 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01788 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01788 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01788 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01788 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01788 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01788 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01788 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01788 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01788 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01788 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01788 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01788 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01788 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01788 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01788 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01788 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01788 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01788 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01788 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01788 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01788 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01788 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01788 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01788 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01788 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01788 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01788 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01788 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01788 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01788 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01788 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01788 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01788 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms