Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01734 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01734 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01734 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01734 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01734 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01734 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
P01734 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01734 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01734 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01734 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01734 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01734 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01734 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01734 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
P01734 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01734 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01734 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
P01734 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01734 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01734 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01734 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01734 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01734 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01734 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01734 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01734 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01734 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
P01734 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01734 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01734 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01734 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01734 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01734 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01734 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01734 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01734 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
P01734 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01734 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01734 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01734 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01734 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01734 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01734 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01734 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01734 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01734 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01734 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01734 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01734 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01734 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01734 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01734 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01734 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01734 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01734 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01734 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01734 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01734 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
P01734 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01734 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01734 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01734 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01734 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01734 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01734 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01734 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01734 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01734 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01734 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01734 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01734 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01734 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P01734 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01734 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01734 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01734 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01734 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01734 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01734 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01734 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
P01734 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01734 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01734 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01734 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01734 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01734 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01734 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms