Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01727 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01727 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01727 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01727 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01727 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01727 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01727 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01727 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01727 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01727 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01727 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01727 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01727 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01727 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01727 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01727 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01727 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01727 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01727 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01727 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01727 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01727 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01727 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01727 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01727 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01727 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01727 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01727 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01727 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01727 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01727 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01727 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01727 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01727 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01727 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01727 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01727 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01727 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01727 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01727 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms