Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01643 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01643 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01643 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01643 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01643 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01643 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01643 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01643 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01643 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01643 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01643 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01643 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01643 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01643 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01643 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01643 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01643 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01643 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01643 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01643 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01643 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01643 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01643 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01643 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01643 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01643 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01643 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01643 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01643 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01643 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01643 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01643 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01643 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01643 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01643 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01643 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01643 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01643 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01643 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01643 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01643 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01643 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01643 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01643 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01643 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01643 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01643 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01643 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01643 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01643 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01643 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01643 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01643 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01643 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01643 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01643 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01643 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01643 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01643 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01643 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01643 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01643 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01643 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01643 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01643 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01643 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01643 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01643 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01643 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01643 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms