Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lancl1O89112 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms