Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MscO88940 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MscO88940 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MscO88940 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MscO88940 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MscO88940 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MscO88940 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MscO88940 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MscO88940 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MscO88940 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MscO88940 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MscO88940 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MscO88940 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MscO88940 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MscO88940 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MscO88940 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MscO88940 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MscO88940 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MscO88940 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MscO88940 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MscO88940 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MscO88940 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MscO88940 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MscO88940 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MscO88940 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MscO88940 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MscO88940 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MscO88940 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MscO88940 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MscO88940 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MscO88940 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MscO88940 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MscO88940 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MscO88940 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MscO88940 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MscO88940 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MscO88940 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MscO88940 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MscO88940 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MscO88940 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MscO88940 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MscO88940 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MscO88940 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MscO88940 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MscO88940 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MscO88940 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MscO88940 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MscO88940 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MscO88940 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MscO88940 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MscO88940 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MscO88940 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MscO88940 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MscO88940 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MscO88940 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MscO88940 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MscO88940 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MscO88940 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MscO88940 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MscO88940 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MscO88940 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MscO88940 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MscO88940 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MscO88940 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MscO88940 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MscO88940 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MscO88940 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MscO88940 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MscO88940 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MscO88940 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MscO88940 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MscO88940 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MscO88940 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MscO88940 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MscO88940 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MscO88940 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MscO88940 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MscO88940 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MscO88940 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MscO88940 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MscO88940 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MscO88940 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MscO88940 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MscO88940 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MscO88940 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MscO88940 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MscO88940 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MscO88940 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MscO88940 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MscO88940 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MscO88940 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MscO88940 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MscO88940 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MscO88940 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MscO88940 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MscO88940 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MscO88940 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MscO88940 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MscO88940 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MscO88940 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms