Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tom1O88746 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tom1O88746 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tom1O88746 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tom1O88746 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tom1O88746 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tom1O88746 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tom1O88746 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tom1O88746 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tom1O88746 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tom1O88746 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tom1O88746 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tom1O88746 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms