Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pak1O88643 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1O88643 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pak1O88643 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1O88643 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pak1O88643 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pak1O88643 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1O88643 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1O88643 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms