Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema3fO88632 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sema3fO88632 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms