Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc27a3O88561 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a3O88561 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a3O88561 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms