Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops3O88543 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops3O88543 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops3O88543 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms