Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfrO88507 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfrO88507 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfrO88507 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CntfrO88507 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfrO88507 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CntfrO88507 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CntfrO88507 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms