Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dync1i1O88485 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dync1i1O88485 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dync1i1O88485 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dync1i1O88485 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dync1i1O88485 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dync1i1O88485 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dync1i1O88485 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms