Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AvilO88398 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AvilO88398 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AvilO88398 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AvilO88398 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AvilO88398 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AvilO88398 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AvilO88398 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AvilO88398 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AvilO88398 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AvilO88398 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AvilO88398 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AvilO88398 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AvilO88398 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AvilO88398 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AvilO88398 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AvilO88398 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AvilO88398 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AvilO88398 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AvilO88398 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AvilO88398 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AvilO88398 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AvilO88398 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AvilO88398 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AvilO88398 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AvilO88398 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AvilO88398 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AvilO88398 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AvilO88398 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AvilO88398 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AvilO88398 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AvilO88398 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AvilO88398 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AvilO88398 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AvilO88398 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AvilO88398 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AvilO88398 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AvilO88398 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AvilO88398 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AvilO88398 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AvilO88398 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AvilO88398 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AvilO88398 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AvilO88398 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AvilO88398 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AvilO88398 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AvilO88398 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AvilO88398 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AvilO88398 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AvilO88398 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AvilO88398 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AvilO88398 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AvilO88398 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AvilO88398 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AvilO88398 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AvilO88398 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AvilO88398 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AvilO88398 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AvilO88398 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AvilO88398 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AvilO88398 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AvilO88398 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AvilO88398 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AvilO88398 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AvilO88398 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AvilO88398 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AvilO88398 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AvilO88398 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AvilO88398 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AvilO88398 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AvilO88398 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AvilO88398 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AvilO88398 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AvilO88398 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AvilO88398 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms