Protein–RNA interactions for Protein: O88324

Cd83, CD83 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd83O88324 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd83O88324 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd83O88324 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd83O88324 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd83O88324 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd83O88324 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd83O88324 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd83O88324 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd83O88324 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd83O88324 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd83O88324 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd83O88324 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd83O88324 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd83O88324 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms