Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clec11aO88200 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms