Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly86O88188 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly86O88188 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly86O88188 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly86O88188 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly86O88188 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly86O88188 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly86O88188 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms