Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfnO70456 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SfnO70456 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfnO70456 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfnO70456 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SfnO70456 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfnO70456 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SfnO70456 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfnO70456 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfnO70456 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfnO70456 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SfnO70456 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfnO70456 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfnO70456 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfnO70456 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfnO70456 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfnO70456 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfnO70456 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfnO70456 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfnO70456 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfnO70456 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SfnO70456 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfnO70456 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SfnO70456 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfnO70456 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfnO70456 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfnO70456 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfnO70456 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfnO70456 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SfnO70456 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SfnO70456 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SfnO70456 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfnO70456 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfnO70456 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfnO70456 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfnO70456 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfnO70456 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfnO70456 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfnO70456 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfnO70456 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfnO70456 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SfnO70456 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfnO70456 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfnO70456 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfnO70456 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfnO70456 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfnO70456 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfnO70456 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfnO70456 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfnO70456 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfnO70456 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SfnO70456 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfnO70456 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfnO70456 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfnO70456 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SfnO70456 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfnO70456 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfnO70456 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SfnO70456 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SfnO70456 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfnO70456 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfnO70456 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfnO70456 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfnO70456 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfnO70456 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfnO70456 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfnO70456 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfnO70456 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfnO70456 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfnO70456 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SfnO70456 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfnO70456 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfnO70456 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfnO70456 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SfnO70456 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SfnO70456 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfnO70456 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfnO70456 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfnO70456 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfnO70456 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SfnO70456 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfnO70456 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfnO70456 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfnO70456 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SfnO70456 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms