Protein–RNA interactions for Protein: O70338

Rnaseh1, Ribonuclease H1, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh1O70338 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnaseh1O70338 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnaseh1O70338 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnaseh1O70338 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnaseh1O70338 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnaseh1O70338 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnaseh1O70338 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnaseh1O70338 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnaseh1O70338 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnaseh1O70338 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnaseh1O70338 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnaseh1O70338 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnaseh1O70338 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms