Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd70O55237 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd70O55237 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd70O55237 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd70O55237 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd70O55237 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd70O55237 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd70O55237 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd70O55237 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd70O55237 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms