Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad51dO55230 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad51dO55230 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms