Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp26a1O55127 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms