Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap2O55126 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap2O55126 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms